到目前為止，已獲得國(guó)家批準(zhǔn)登記的微生物肥料只有400多種，實(shí)際上生產(chǎn)的廠家已超過2000多家，市場(chǎng)上銷售的微生物肥料良莠不齊，為了維護(hù)廣大農(nóng)民的切身利益，在選購(gòu)、應(yīng)用時(shí)應(yīng)注意以下幾個(gè)問題：
1、沒有獲得農(nóng)業(yè)部登記證產(chǎn)品不能購(gòu)買國(guó)家規(guī)定微生物肥料必須經(jīng)農(nóng)業(yè)部指定單位檢驗(yàn)和正規(guī)田間試驗(yàn)，證明其效益、、后由農(nóng)業(yè)部批準(zhǔn)登記，而且先發(fā)給臨時(shí)登記證，經(jīng)3年實(shí)際應(yīng)用檢驗(yàn)可靠后再發(fā)給正式登記證，正式登記證有效期5年。沒有獲得農(nóng)業(yè)部登記證的微生物肥料，質(zhì)量有可能有問題，不要購(gòu)買和使用。
2、有效活菌數(shù)達(dá)不到標(biāo)準(zhǔn)的微生物肥料不能購(gòu)買國(guó)家規(guī)定微生物菌劑有效活菌數(shù) 2億/克（顆粒1億/克），復(fù)合微生物肥料和生物有機(jī)肥有效活菌數(shù) 2000萬/克。如果達(dá)不到這一標(biāo)準(zhǔn)，說明產(chǎn)品質(zhì)量達(dá)不到要求。
3、存放時(shí)間超過有效期的微生物肥料不要使用目前我國(guó)微生物肥料有效菌存活時(shí)間超過1年的不多，所以選購(gòu)的微生物肥料要盡快使用，過期的微生物肥料效果肯定不好。
4、存放條件和使用方法須嚴(yán)格按規(guī)定辦微生物肥料中很多有效活菌不耐高低溫和強(qiáng)光照射，不耐強(qiáng)酸堿，不能與某些化肥和劑混合，在使用微生物肥料時(shí)必須按產(chǎn)品說明書進(jìn)行科學(xué)保存和使用。